Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MGME1Q9BQP7 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MGME1Q9BQP7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MGME1Q9BQP7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MGME1Q9BQP7 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MGME1Q9BQP7 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MGME1Q9BQP7 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MGME1Q9BQP7 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MGME1Q9BQP7 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MGME1Q9BQP7 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MGME1Q9BQP7 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MGME1Q9BQP7 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MGME1Q9BQP7 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MGME1Q9BQP7 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MGME1Q9BQP7 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MGME1Q9BQP7 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MGME1Q9BQP7 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MGME1Q9BQP7 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MGME1Q9BQP7 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MGME1Q9BQP7 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MGME1Q9BQP7 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MGME1Q9BQP7 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MGME1Q9BQP7 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGME1Q9BQP7 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms