Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PKP4P1-201ENST00000426801 2158 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC005921.3-201ENST00000623774 2151 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PSMD2-205ENST00000435761 2574 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GADL1-201ENST00000282538 3759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PNPO-217ENST00000642017 3465 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AL354919.1-201ENST00000453837 2257 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DDB2-201ENST00000256996 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC087164.2-201ENST00000624514 3130 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CHRNA1-208ENST00000636168 1862 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DNAL1-201ENST00000311089 2312 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 KRT17P7-202ENST00000582261 2334 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC091178.1-201ENST00000583447 2305 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CADM3-202ENST00000368125 3745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 EHD1-213ENST00000621096 3336 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CES1-201ENST00000360526 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MZF1-AS1-202ENST00000600534 2567 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZSCAN31-201ENST00000344279 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PAX6-207ENST00000379129 2614 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms