Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 LITAF-203ENST00000413364 2292 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CBX3Q13185 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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