Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 PNMA5-203ENST00000439251 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 NEK11-209ENST00000510688 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 UBP1-204ENST00000447368 3669 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 VAT1L-201ENST00000302536 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 EDARADD-204ENST00000637660 2803 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 IL1RAP-211ENST00000439062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 DUSP4-202ENST00000240101 2959 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 ZNF140-202ENST00000355557 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 TNKS-213ENST00000522110 2900 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 MDGA1-207ENST00000505425 3021 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CD300CQ08708 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms