Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP1-1Q07627 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms