Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DYNC1LI1Q9Y6G9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DYNC1LI1Q9Y6G9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms