Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J2

EPB41L3, Band 4.1-like protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L3Q9Y2J2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPB41L3Q9Y2J2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPB41L3Q9Y2J2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPB41L3Q9Y2J2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPB41L3Q9Y2J2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPB41L3Q9Y2J2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPB41L3Q9Y2J2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPB41L3Q9Y2J2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPB41L3Q9Y2J2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPB41L3Q9Y2J2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPB41L3Q9Y2J2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPB41L3Q9Y2J2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPB41L3Q9Y2J2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPB41L3Q9Y2J2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPB41L3Q9Y2J2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPB41L3Q9Y2J2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPB41L3Q9Y2J2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPB41L3Q9Y2J2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPB41L3Q9Y2J2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPB41L3Q9Y2J2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPB41L3Q9Y2J2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EPB41L3Q9Y2J2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EPB41L3Q9Y2J2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41L3Q9Y2J2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms