Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
TRAPPC4Q9Y296 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAPPC4Q9Y296 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms