Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PALD1Q9ULE6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PALD1Q9ULE6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PALD1Q9ULE6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PALD1Q9ULE6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PALD1Q9ULE6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PALD1Q9ULE6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PALD1Q9ULE6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PALD1Q9ULE6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PALD1Q9ULE6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PALD1Q9ULE6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PALD1Q9ULE6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PALD1Q9ULE6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PALD1Q9ULE6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PALD1Q9ULE6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PALD1Q9ULE6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PALD1Q9ULE6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PALD1Q9ULE6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PALD1Q9ULE6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PALD1Q9ULE6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PALD1Q9ULE6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PALD1Q9ULE6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PALD1Q9ULE6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PALD1Q9ULE6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PALD1Q9ULE6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PALD1Q9ULE6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PALD1Q9ULE6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PALD1Q9ULE6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PALD1Q9ULE6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PALD1Q9ULE6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PALD1Q9ULE6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PALD1Q9ULE6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PALD1Q9ULE6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PALD1Q9ULE6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms