Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC5

MYO1A, Unconventional myosin-Ia, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1AQ9UBC5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO1AQ9UBC5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYO1AQ9UBC5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYO1AQ9UBC5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYO1AQ9UBC5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYO1AQ9UBC5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYO1AQ9UBC5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYO1AQ9UBC5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYO1AQ9UBC5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYO1AQ9UBC5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYO1AQ9UBC5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYO1AQ9UBC5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYO1AQ9UBC5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYO1AQ9UBC5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms