Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 SEPT2-212ENST00000425899 738 ntTSL 512.69□□□□□ -0.383e-6■■■■□ 23.5
AATFQ9NY61 SEPT2-214ENST00000428524 644 ntTSL 512.2□□□□□ -0.463e-6■■■■□ 23.5
AATFQ9NY61 PCNT-205ENST00000480896 10485 ntTSL 1 (best)11.65□□□□□ -0.543e-6■■■■□ 23.5
AATFQ9NY61 PCNT-201ENST00000359568 10560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.583e-6■■■■□ 23.5
AATFQ9NY61 SEPT2-219ENST00000441533 372 ntTSL 510□□□□□ -0.813e-6■■■■□ 23.5
AATFQ9NY61 SEPT2-207ENST00000407017 650 ntTSL 49.43□□□□□ -0.93e-6■■■■□ 23.5
AATFQ9NY61 SEPT2-221ENST00000445030 575 ntTSL 39.43□□□□□ -0.93e-6■■■■□ 23.5
AATFQ9NY61 SEPT2-241ENST00000484740 563 ntTSL 37.14□□□□□ -1.273e-6■■■■□ 23.5
AATFQ9NY61 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.293e-6■■■■□ 23.5
AATFQ9NY61 SEPT2-232ENST00000469434 583 ntTSL 35.13□□□□□ -1.593e-6■■■■□ 23.5
AATFQ9NY61 SEPT2-233ENST00000473479 659 ntTSL 23.86□□□□□ -1.793e-6■■■■□ 23.5
AATFQ9NY61 CBFA2T3-207ENST00000564416 399 ntTSL 518.76■□□□□ 0.594e-6■■■■□ 23.2
AATFQ9NY61 FOXRED1-203ENST00000525083 1228 ntTSL 221.28■■□□□ 15e-6■■■■□ 23
AATFQ9NY61 FOXRED1-207ENST00000527004 1760 ntTSL 518.49■□□□□ 0.555e-6■■■■□ 23
AATFQ9NY61 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.555e-6■■■■□ 23
AATFQ9NY61 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.475e-6■■■■□ 23
AATFQ9NY61 FOXRED1-204ENST00000525770 1427 ntTSL 217.87■□□□□ 0.455e-6■■■■□ 23
AATFQ9NY61 FOXRED1-218ENST00000534315 2210 ntTSL 1 (best)15.84■□□□□ 0.135e-6■■■■□ 23
AATFQ9NY61 FOXRED1-217ENST00000534011 1955 ntTSL 215.82■□□□□ 0.125e-6■■■■□ 23
AATFQ9NY61 FOXRED1-216ENST00000533839 559 ntTSL 411.69□□□□□ -0.545e-6■■■■□ 23
AATFQ9NY61 FOXRED1-210ENST00000530642 3045 ntTSL 29.69□□□□□ -0.865e-6■■■■□ 23
AATFQ9NY61 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.876e-8■■■■□ 22.8
AATFQ9NY61 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.646e-8■■■■□ 22.8
AATFQ9NY61 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.516e-8■■■■□ 22.8
AATFQ9NY61 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.286e-8■■■■□ 22.8
AATFQ9NY61 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.026e-8■■■■□ 22.8
AATFQ9NY61 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.896e-8■■■■□ 22.8
AATFQ9NY61 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.756e-8■■■■□ 22.8
AATFQ9NY61 C22orf39-204ENST00000509549 2979 ntTSL 214.46□□□□□ -0.16e-8■■■■□ 22.8
AATFQ9NY61 AL591684.2-202ENST00000431840 1241 ntTSL 214.12□□□□□ -0.156e-8■■■■□ 22.8
AATFQ9NY61 HIRA-203ENST00000452818 453 ntTSL 513.74□□□□□ -0.216e-8■■■■□ 22.8
AATFQ9NY61 BMS1P2-201ENST00000450360 1333 ntBASIC13.08□□□□□ -0.326e-8■■■■□ 22.8
AATFQ9NY61 BMS1P2-202ENST00000532854 1858 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.716e-8■■■■□ 22.8
AATFQ9NY61 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.925e-56■■■■□ 22.6
AATFQ9NY61 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.95e-56■■■■□ 22.6
AATFQ9NY61 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.75e-56■■■■□ 22.6
AATFQ9NY61 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.625e-56■■■■□ 22.6
AATFQ9NY61 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.545e-56■■■■□ 22.6
AATFQ9NY61 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.375e-56■■■■□ 22.6
AATFQ9NY61 ELOF1-207ENST00000591674 679 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.765e-56■■■■□ 22.6
AATFQ9NY61 CARD9-203ENST00000460290 1061 ntTSL 330.51■■■□□ 2.472e-8■■■■□ 22.6
AATFQ9NY61 NECAB3-212ENST00000485976 1016 ntTSL 527.42■■□□□ 1.982e-8■■■■□ 22.6
AATFQ9NY61 NECAB3-211ENST00000485399 1373 ntTSL 226.1■■□□□ 1.772e-8■■■■□ 22.6
AATFQ9NY61 NECAB3-222ENST00000607805 969 ntTSL 525.84■■□□□ 1.732e-8■■■■□ 22.6
AATFQ9NY61 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.492e-8■■■■□ 22.6
AATFQ9NY61 NECAB3-217ENST00000606106 591 ntTSL 423.89■■□□□ 1.412e-8■■■■□ 22.6
AATFQ9NY61 NECAB3-215ENST00000494174 859 ntTSL 523.89■■□□□ 1.412e-8■■■■□ 22.6
AATFQ9NY61 NECAB3-213ENST00000488489 2142 ntTSL 223.87■■□□□ 1.412e-8■■■■□ 22.6
AATFQ9NY61 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.292e-8■■■■□ 22.6
AATFQ9NY61 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.232e-8■■■■□ 22.6
AATFQ9NY61 NECAB3-220ENST00000606699 1022 ntTSL 222.68■■□□□ 1.222e-8■■■■□ 22.6
AATFQ9NY61 CARD9-206ENST00000489932 1912 ntTSL 522.62■■□□□ 1.212e-8■■■■□ 22.6
AATFQ9NY61 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.112e-8■■■■□ 22.6
AATFQ9NY61 NECAB3-208ENST00000480994 732 ntTSL 520.6■□□□□ 0.892e-8■■■■□ 22.6
AATFQ9NY61 NECAB3-214ENST00000493590 625 ntTSL 520.49■□□□□ 0.872e-8■■■■□ 22.6
AATFQ9NY61 CARD9-204ENST00000481053 4060 ntTSL 220.43■□□□□ 0.862e-8■■■■□ 22.6
AATFQ9NY61 CARD9-205ENST00000485975 4574 ntTSL 218.45■□□□□ 0.542e-8■■■■□ 22.6
AATFQ9NY61 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.532e-8■■■■□ 22.6
AATFQ9NY61 NECAB3-219ENST00000606690 900 ntTSL 517.59■□□□□ 0.412e-8■■■■□ 22.6
AATFQ9NY61 NECAB3-203ENST00000439478 925 ntTSL 517.59■□□□□ 0.412e-8■■■■□ 22.6
AATFQ9NY61 SMCHD1-205ENST00000581383 806 ntTSL 33.46□□□□□ -1.862e-8■■■■□ 22.6
AATFQ9NY61 SMCHD1-203ENST00000577880 4951 ntTSL 23.33□□□□□ -1.882e-8■■■■□ 22.6
AATFQ9NY61 SMCHD1-211ENST00000584897 4143 ntTSL 21.97□□□□□ -2.092e-8■■■■□ 22.6
AATFQ9NY61 DDX39B-201ENST00000376177 1529 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.261e-10■■■■□ 22.6
AATFQ9NY61 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.063e-10■■■■□ 22.5
AATFQ9NY61 FAM20B-202ENST00000440702 603 ntTSL 321.04■□□□□ 0.963e-10■■■■□ 22.5
AATFQ9NY61 GUK1-214ENST00000460224 639 ntTSL 518.96■□□□□ 0.638e-7■■■■□ 22.5
AATFQ9NY61 GUK1-226ENST00000484953 273 ntTSL 216.96■□□□□ 0.318e-7■■■■□ 22.5
AATFQ9NY61 GUK1-233ENST00000491613 959 ntTSL 316.57■□□□□ 0.248e-7■■■■□ 22.5
AATFQ9NY61 GUK1-221ENST00000472939 314 ntTSL 316.28■□□□□ 0.28e-7■■■■□ 22.5
AATFQ9NY61 GUK1-211ENST00000412265 1012 ntTSL 516.28■□□□□ 0.28e-7■■■■□ 22.5
AATFQ9NY61 GUK1-229ENST00000485733 345 ntTSL 315.33■□□□□ 0.048e-7■■■■□ 22.5
AATFQ9NY61 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.712e-73■■■■□ 22.5
AATFQ9NY61 SKI-204ENST00000508416 252 ntTSL 312.8□□□□□ -0.363e-6■■■■□ 22.4
AATFQ9NY61 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.874e-6■■■■□ 22.4
AATFQ9NY61 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.724e-6■■■■□ 22.4
AATFQ9NY61 AKT1-215ENST00000555926 553 ntTSL 323.84■■□□□ 1.414e-6■■■■□ 22.4
AATFQ9NY61 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.324e-6■■■■□ 22.4
AATFQ9NY61 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.54e-6■■■■□ 22.4
AATFQ9NY61 AKT1-208ENST00000554581 3916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.174e-6■■■■□ 22.4
AATFQ9NY61 AKT1-212ENST00000555380 534 ntTSL 413.87□□□□□ -0.194e-6■■■■□ 22.4
AATFQ9NY61 AKT1-202ENST00000402615 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.324e-6■■■■□ 22.4
AATFQ9NY61 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.838e-7■■■■□ 22.3
AATFQ9NY61 UNKL-210ENST00000508903 3430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.068e-7■■■■□ 22.3
AATFQ9NY61 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.548e-21■■■■□ 22.3
AATFQ9NY61 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.378e-21■■■■□ 22.3
AATFQ9NY61 RPS20-203ENST00000519369 824 ntTSL 216.27■□□□□ 0.28e-21■■■■□ 22.3
AATFQ9NY61 RPS20-208ENST00000521262 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.028e-21■■■■□ 22.3
AATFQ9NY61 RPS20-209ENST00000521289 737 ntTSL 513.53□□□□□ -0.248e-21■■■■□ 22.3
AATFQ9NY61 RPS20-212ENST00000618656 627 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.568e-21■■■■□ 22.3
AATFQ9NY61 RPS20-207ENST00000520627 423 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.588e-21■■■■□ 22.3
AATFQ9NY61 RPS20-201ENST00000009589 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.748e-21■■■■□ 22.3
AATFQ9NY61 RPS20-204ENST00000519606 424 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.748e-21■■■■□ 22.3
AATFQ9NY61 RPS20-206ENST00000520490 402 ntTSL 39.76□□□□□ -0.858e-21■■■■□ 22.3
AATFQ9NY61 RPS20-205ENST00000519807 1826 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.948e-21■■■■□ 22.3
AATFQ9NY61 RPS20-202ENST00000518875 671 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.028e-21■■■■□ 22.3
AATFQ9NY61 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.878e-21■■■■□ 22.3
AATFQ9NY61 HSPA8-208ENST00000526686 740 ntTSL 1 (best)3.45□□□□□ -1.861e-323■■■■□ 22.3
AATFQ9NY61 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.331e-51■■■■□ 22.2
AATFQ9NY61 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.231e-51■■■■□ 22.2
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