Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EBF2Q9HAK2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EBF2Q9HAK2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EBF2Q9HAK2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 642 ms