Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCG3Q8WXD2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCG3Q8WXD2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCG3Q8WXD2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms