Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC71Q8IV32 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC71Q8IV32 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms