Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA1

PRPF39, Pre-mRNA-processing factor 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39Q86UA1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRPF39Q86UA1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF39Q86UA1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms