Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00523Q86TU6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00523Q86TU6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms