Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNA4

RNF111, E3 ubiquitin-protein ligase Arkadia, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF111Q6ZNA4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF111Q6ZNA4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF111Q6ZNA4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RNF111Q6ZNA4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms