Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDP4

KLHL17, Kelch-like protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL17Q6TDP4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL17Q6TDP4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL17Q6TDP4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms