Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUI8

C19orf48, Uncharacterized protein C19orf48, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf48Q6RUI8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C19orf48Q6RUI8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C19orf48Q6RUI8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C19orf48Q6RUI8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C19orf48Q6RUI8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C19orf48Q6RUI8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C19orf48Q6RUI8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C19orf48Q6RUI8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C19orf48Q6RUI8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C19orf48Q6RUI8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C19orf48Q6RUI8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C19orf48Q6RUI8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C19orf48Q6RUI8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C19orf48Q6RUI8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C19orf48Q6RUI8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C19orf48Q6RUI8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C19orf48Q6RUI8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C19orf48Q6RUI8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C19orf48Q6RUI8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C19orf48Q6RUI8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C19orf48Q6RUI8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C19orf48Q6RUI8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C19orf48Q6RUI8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C19orf48Q6RUI8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C19orf48Q6RUI8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C19orf48Q6RUI8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C19orf48Q6RUI8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C19orf48Q6RUI8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C19orf48Q6RUI8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C19orf48Q6RUI8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms