Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY0

BLOC1S3, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S3Q6QNY0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
BLOC1S3Q6QNY0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BLOC1S3Q6QNY0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BLOC1S3Q6QNY0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BLOC1S3Q6QNY0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BLOC1S3Q6QNY0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BLOC1S3Q6QNY0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BLOC1S3Q6QNY0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BLOC1S3Q6QNY0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BLOC1S3Q6QNY0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BLOC1S3Q6QNY0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BLOC1S3Q6QNY0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BLOC1S3Q6QNY0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BLOC1S3Q6QNY0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BLOC1S3Q6QNY0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BLOC1S3Q6QNY0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BLOC1S3Q6QNY0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BLOC1S3Q6QNY0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BLOC1S3Q6QNY0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BLOC1S3Q6QNY0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BLOC1S3Q6QNY0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BLOC1S3Q6QNY0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BLOC1S3Q6QNY0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BLOC1S3Q6QNY0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BLOC1S3Q6QNY0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BLOC1S3Q6QNY0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BLOC1S3Q6QNY0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BLOC1S3Q6QNY0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BLOC1S3Q6QNY0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BLOC1S3Q6QNY0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BLOC1S3Q6QNY0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BLOC1S3Q6QNY0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms