Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
AGAP9Q5VTM2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGAP9Q5VTM2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms