Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PCGF3Q3KNV8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PCGF3Q3KNV8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.2 ms