Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCD2Q16342 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCD2Q16342 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
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