Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF1Q15637 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF1Q15637 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF1Q15637 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF1Q15637 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF1Q15637 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF1Q15637 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF1Q15637 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF1Q15637 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF1Q15637 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF1Q15637 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SF1Q15637 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SF1Q15637 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SF1Q15637 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SF1Q15637 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SF1Q15637 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SF1Q15637 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SF1Q15637 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SF1Q15637 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SF1Q15637 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SF1Q15637 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF1Q15637 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF1Q15637 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF1Q15637 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF1Q15637 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF1Q15637 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF1Q15637 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF1Q15637 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF1Q15637 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF1Q15637 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF1Q15637 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF1Q15637 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF1Q15637 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF1Q15637 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF1Q15637 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF1Q15637 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SF1Q15637 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SF1Q15637 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SF1Q15637 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SF1Q15637 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SF1Q15637 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SF1Q15637 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SF1Q15637 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SF1Q15637 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SF1Q15637 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SF1Q15637 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SF1Q15637 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SF1Q15637 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SF1Q15637 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SF1Q15637 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SF1Q15637 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SF1Q15637 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SF1Q15637 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SF1Q15637 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SF1Q15637 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SF1Q15637 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SF1Q15637 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SF1Q15637 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SF1Q15637 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SF1Q15637 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SF1Q15637 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SF1Q15637 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SF1Q15637 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SF1Q15637 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SF1Q15637 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SF1Q15637 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SF1Q15637 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SF1Q15637 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SF1Q15637 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SF1Q15637 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SF1Q15637 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SF1Q15637 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SF1Q15637 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SF1Q15637 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SF1Q15637 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SF1Q15637 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SF1Q15637 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SF1Q15637 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SF1Q15637 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SF1Q15637 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SF1Q15637 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SF1Q15637 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SF1Q15637 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SF1Q15637 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SF1Q15637 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SF1Q15637 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SF1Q15637 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SF1Q15637 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SF1Q15637 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SF1Q15637 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SF1Q15637 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SF1Q15637 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SF1Q15637 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SF1Q15637 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SF1Q15637 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SF1Q15637 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SF1Q15637 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SF1Q15637 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SF1Q15637 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SF1Q15637 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
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