Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HERPUD1Q15011 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERPUD1Q15011 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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