Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SELENBP1Q13228 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SELENBP1Q13228 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms