Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB40BQ12829 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB40BQ12829 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB40BQ12829 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB40BQ12829 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB40BQ12829 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB40BQ12829 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB40BQ12829 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB40BQ12829 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB40BQ12829 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB40BQ12829 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB40BQ12829 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB40BQ12829 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB40BQ12829 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB40BQ12829 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB40BQ12829 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB40BQ12829 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB40BQ12829 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB40BQ12829 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB40BQ12829 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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RAB40BQ12829 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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RAB40BQ12829 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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RAB40BQ12829 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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RAB40BQ12829 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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RAB40BQ12829 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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RAB40BQ12829 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB40BQ12829 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB40BQ12829 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB40BQ12829 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB40BQ12829 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB40BQ12829 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB40BQ12829 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB40BQ12829 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB40BQ12829 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB40BQ12829 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB40BQ12829 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB40BQ12829 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB40BQ12829 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB40BQ12829 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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