Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVFRD-1P60508 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERVFRD-1P60508 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms