Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELLP55199 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ELLP55199 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELLP55199 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELLP55199 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELLP55199 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELLP55199 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELLP55199 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELLP55199 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELLP55199 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELLP55199 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELLP55199 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELLP55199 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELLP55199 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELLP55199 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ELLP55199 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ELLP55199 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ELLP55199 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ELLP55199 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ELLP55199 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ELLP55199 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ELLP55199 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ELLP55199 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELLP55199 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELLP55199 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELLP55199 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELLP55199 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELLP55199 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELLP55199 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELLP55199 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ELLP55199 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELLP55199 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELLP55199 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELLP55199 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELLP55199 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELLP55199 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ELLP55199 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ELLP55199 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ELLP55199 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ELLP55199 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ELLP55199 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ELLP55199 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ELLP55199 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ELLP55199 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ELLP55199 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELLP55199 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELLP55199 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELLP55199 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELLP55199 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELLP55199 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELLP55199 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ELLP55199 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELLP55199 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELLP55199 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELLP55199 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELLP55199 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELLP55199 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELLP55199 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELLP55199 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELLP55199 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELLP55199 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELLP55199 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ELLP55199 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELLP55199 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELLP55199 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ELLP55199 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELLP55199 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELLP55199 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ELLP55199 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELLP55199 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELLP55199 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELLP55199 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELLP55199 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELLP55199 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELLP55199 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELLP55199 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ELLP55199 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELLP55199 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELLP55199 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELLP55199 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELLP55199 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELLP55199 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELLP55199 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELLP55199 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELLP55199 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELLP55199 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELLP55199 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELLP55199 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELLP55199 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELLP55199 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ELLP55199 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELLP55199 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELLP55199 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELLP55199 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELLP55199 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELLP55199 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELLP55199 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELLP55199 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELLP55199 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ELLP55199 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms