Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 CKMT2-AS1-202ENST00000501927 2463 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.253e-8■■■■■ 32
HNRNPMP52272 PRDM15-202ENST00000398548 6654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.313e-8■■■■■ 32
HNRNPMP52272 GIPC2-202ENST00000476882 312 ntTSL 313.13□□□□□ -0.313e-8■■■■■ 32
HNRNPMP52272 PRDM15-205ENST00000441787 6542 ntTSL 1 (best)12.94□□□□□ -0.343e-8■■■■■ 32
HNRNPMP52272 CKMT2-AS1-206ENST00000511495 585 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.373e-8■■■■■ 32
HNRNPMP52272 PRDM15-203ENST00000422911 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.413e-8■■■■■ 32
HNRNPMP52272 RCBTB1-202ENST00000378302 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.493e-8■■■■■ 32
HNRNPMP52272 PRDM15-212ENST00000486812 7072 ntTSL 1 (best)11.74□□□□□ -0.533e-8■■■■■ 32
HNRNPMP52272 RCBTB1-201ENST00000258646 3816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.533e-8■■■■■ 32
HNRNPMP52272 IPO11-214ENST00000514647 584 ntTSL 211.51□□□□□ -0.573e-8■■■■■ 32
HNRNPMP52272 IPO11-201ENST00000325324 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.673e-8■■■■■ 32
HNRNPMP52272 IPO11-205ENST00000424533 3005 ntTSL 210.86□□□□□ -0.673e-8■■■■■ 32
HNRNPMP52272 IPO11-208ENST00000506200 554 ntTSL 410.05□□□□□ -0.83e-8■■■■■ 32
HNRNPMP52272 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.993e-8■■■■■ 32
HNRNPMP52272 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.042e-6■■■■■ 32
HNRNPMP52272 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.199e-7■■■■■ 32
HNRNPMP52272 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.413e-8■■■■■ 32
HNRNPMP52272 MARCH7-204ENST00000420397 983 ntTSL 55.49□□□□□ -1.533e-8■■■■■ 32
HNRNPMP52272 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.573e-8■■■■■ 32
HNRNPMP52272 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.893e-8■■■■■ 32
HNRNPMP52272 NSD2-227ENST00000515806 816 ntTSL 316.98■□□□□ 0.318e-8■■■■■ 32
HNRNPMP52272 AC009716.2-201ENST00000624840 3765 ntBASIC15.51■□□□□ 0.078e-8■■■■■ 32
HNRNPMP52272 GLMN-205ENST00000495106 1833 ntTSL 1 (best)5.8□□□□□ -1.485e-8■■■■■ 31.9
HNRNPMP52272 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.955e-8■■■■■ 31.9
HNRNPMP52272 ARID1B-213ENST00000636205 824 ntTSL 211.25□□□□□ -0.615e-7■■■■■ 31.9
HNRNPMP52272 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.445e-7■■■■■ 31.9
HNRNPMP52272 SP140L-205ENST00000458341 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.845e-7■■■■■ 31.9
HNRNPMP52272 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.665e-7■■■■■ 31.9
HNRNPMP52272 SP140L-202ENST00000396563 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.285e-7■■■■■ 31.9
HNRNPMP52272 SP140L-201ENST00000243810 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.615e-7■■■■■ 31.9
HNRNPMP52272 KIAA1191-207ENST00000506668 741 ntTSL 220.88■□□□□ 0.935e-8■■■■■ 31.9
HNRNPMP52272 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.885e-8■■■■■ 31.9
HNRNPMP52272 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.75e-8■■■■■ 31.9
HNRNPMP52272 KIAA1191-211ENST00000533553 560 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.655e-8■■■■■ 31.9
HNRNPMP52272 KIAA1191-205ENST00000504688 486 ntTSL 518.79■□□□□ 0.65e-8■■■■■ 31.9
HNRNPMP52272 KIAA1191-208ENST00000506983 512 ntTSL 218.03■□□□□ 0.485e-8■■■■■ 31.9
HNRNPMP52272 KIAA1191-204ENST00000503082 639 ntTSL 218.02■□□□□ 0.485e-8■■■■■ 31.9
HNRNPMP52272 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.315e-8■■■■■ 31.9
HNRNPMP52272 KIAA1191-203ENST00000393728 2243 ntTSL 1 (best)15.64■□□□□ 0.095e-8■■■■■ 31.9
HNRNPMP52272 KIAA1191-213ENST00000620366 2452 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.055e-8■■■■■ 31.9
HNRNPMP52272 KIAA1191-212ENST00000614420 2631 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.055e-8■■■■■ 31.9
HNRNPMP52272 PRKCZ-222ENST00000496325 563 ntTSL 424.89■■□□□ 1.582e-7■■■■■ 31.9
HNRNPMP52272 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.223e-7■■■■■ 31.9
HNRNPMP52272 SMYD3-210ENST00000470863 983 ntTSL 225.03■■□□□ 1.63e-7■■■■■ 31.9
HNRNPMP52272 RAPGEF2-206ENST00000505478 838 ntTSL 56.3□□□□□ -1.41e-7■■■■■ 31.8
HNRNPMP52272 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.215e-7■■■■■ 31.8
HNRNPMP52272 AFDN-209ENST00000400825 963 ntTSL 545.83■■■■■ 4.934e-7■■■■■ 31.8
HNRNPMP52272 AFDN-208ENST00000400824 875 ntTSL 542.78■■■■■ 4.444e-7■■■■■ 31.8
HNRNPMP52272 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.765e-7■■■■■ 31.8
HNRNPMP52272 NPM1-208ENST00000521672 597 ntTSL 512.57□□□□□ -0.45e-7■■■■■ 31.8
HNRNPMP52272 NPM1-204ENST00000517671 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.45e-7■■■■■ 31.8
HNRNPMP52272 NPM1-205ENST00000518587 670 ntTSL 29.86□□□□□ -0.835e-7■■■■■ 31.8
HNRNPMP52272 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.085e-7■■■■■ 31.8
HNRNPMP52272 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.185e-7■■■■■ 31.8
HNRNPMP52272 NPM1-210ENST00000523339 268 ntTSL 26.24□□□□□ -1.415e-7■■■■■ 31.8
HNRNPMP52272 NPM1-211ENST00000523622 247 ntTSL 36.11□□□□□ -1.435e-7■■■■■ 31.8
HNRNPMP52272 HGS-212ENST00000575058 632 ntTSL 326.29■■□□□ 1.81e-9■■■■■ 31.8
HNRNPMP52272 HGS-204ENST00000571237 878 ntTSL 325.77■■□□□ 1.721e-9■■■■■ 31.8
HNRNPMP52272 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.489e-7■■■■■ 31.8
HNRNPMP52272 ADAM10-212ENST00000558004 587 ntTSL 528.68■■■□□ 2.183e-7■■■■■ 31.8
HNRNPMP52272 ADAM10-216ENST00000561149 529 ntTSL 425.24■■□□□ 1.633e-7■■■■■ 31.8
HNRNPMP52272 ADAM10-213ENST00000558733 995 ntTSL 323.43■■□□□ 1.343e-7■■■■■ 31.8
HNRNPMP52272 ADAM10-215ENST00000560608 587 ntTSL 422.61■■□□□ 1.213e-7■■■■■ 31.8
HNRNPMP52272 ADAM10-204ENST00000439637 601 ntTSL 321.76■■□□□ 1.073e-7■■■■■ 31.8
HNRNPMP52272 ADAM10-214ENST00000559053 541 ntTSL 415.07■□□□□ 03e-7■■■■■ 31.8
HNRNPMP52272 ADAM10-211ENST00000497846 647 ntTSL 411.48□□□□□ -0.573e-7■■■■■ 31.8
HNRNPMP52272 TMBIM6-216ENST00000549130 446 ntTSL 513.48□□□□□ -0.253e-7■■■■■ 31.8
HNRNPMP52272 AC022336.3-201ENST00000624807 1986 ntBASIC15.61■□□□□ 0.092e-7■■■■■ 31.7
HNRNPMP52272 MAP4K3-206ENST00000437968 500 ntTSL 543.22■■■■■ 4.516e-7■■■■■ 31.7
HNRNPMP52272 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.826e-7■■■■■ 31.7
HNRNPMP52272 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.058e-7■■■■■ 31.7
HNRNPMP52272 C16orf72-202ENST00000574285 10359 ntTSL 25.77□□□□□ -1.498e-7■■■■■ 31.7
HNRNPMP52272 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.362e-9■■■■■ 31.7
HNRNPMP52272 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.152e-9■■■■■ 31.7
HNRNPMP52272 PCGF3-206ENST00000433814 639 ntTSL 424.93■■□□□ 1.582e-9■■■■■ 31.7
HNRNPMP52272 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.52e-9■■■■■ 31.7
HNRNPMP52272 LINC01237-205ENST00000457686 586 ntTSL 423.44■■□□□ 1.342e-9■■■■■ 31.7
HNRNPMP52272 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.22e-9■■■■■ 31.7
HNRNPMP52272 EHMT1-218ENST00000495657 649 ntTSL 520.54■□□□□ 0.886e-8■■■■■ 31.7
HNRNPMP52272 RABL6-205ENST00000435930 3328 ntTSL 220.19■□□□□ 0.822e-9■■■■■ 31.7
HNRNPMP52272 RABL6-207ENST00000461992 763 ntTSL 1 (best)20.06■□□□□ 0.82e-9■■■■■ 31.7
HNRNPMP52272 RABL6-209ENST00000466096 3949 ntTSL 1 (best)18.79■□□□□ 0.62e-9■■■■■ 31.7
HNRNPMP52272 NOL10-201ENST00000345985 3333 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.442e-9■■■■■ 31.7
HNRNPMP52272 NOL10-205ENST00000538384 3418 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.122e-9■■■■■ 31.7
HNRNPMP52272 NOL10-202ENST00000381685 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.232e-9■■■■■ 31.7
HNRNPMP52272 AC020687.1-201ENST00000560439 448 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.462e-9■■■■■ 31.7
HNRNPMP52272 NOL10-203ENST00000431319 827 ntTSL 35.2□□□□□ -1.582e-9■■■■■ 31.7
HNRNPMP52272 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.791e-8■■■■■ 31.7
HNRNPMP52272 FBXL4-202ENST00000369244 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.711e-8■■■■■ 31.7
HNRNPMP52272 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.055e-7■■■■■ 31.7
HNRNPMP52272 VPS13B-211ENST00000522802 570 ntTSL 310.5□□□□□ -0.731e-7■■■■■ 31.6
HNRNPMP52272 SHPRH-201ENST00000275233 6649 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -02e-6■■■■■ 31.6
HNRNPMP52272 SHPRH-211ENST00000629427 7338 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 31.6
HNRNPMP52272 SHPRH-206ENST00000438092 6994 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 31.6
HNRNPMP52272 SHPRH-203ENST00000367505 7201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.772e-6■■■■■ 31.6
HNRNPMP52272 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.932e-7■■■■■ 31.6
HNRNPMP52272 KLF13-206ENST00000558921 440 ntTSL 341.78■■■■■ 4.283e-8■■■■■ 31.6
HNRNPMP52272 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.293e-8■■■■■ 31.6
HNRNPMP52272 DDX39A-214ENST00000590556 575 ntTSL 229.52■■■□□ 2.325e-15■■■■■ 31.6
HNRNPMP52272 DDX39A-213ENST00000590315 566 ntTSL 519.76■□□□□ 0.755e-15■■■■■ 31.6
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 348.6 ms