Protein–RNA interactions for Protein: P51805

PLXNA3, Plexin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA3P51805 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLXNA3P51805 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PLXNA3P51805 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLXNA3P51805 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 317.3 ms