Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASP4P49662 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASP4P49662 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASP4P49662 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASP4P49662 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASP4P49662 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASP4P49662 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASP4P49662 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASP4P49662 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASP4P49662 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASP4P49662 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASP4P49662 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASP4P49662 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP4P49662 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP4P49662 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP4P49662 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP4P49662 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP4P49662 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CASP4P49662 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP4P49662 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP4P49662 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP4P49662 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP4P49662 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP4P49662 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP4P49662 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP4P49662 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP4P49662 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP4P49662 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP4P49662 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP4P49662 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP4P49662 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP4P49662 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP4P49662 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP4P49662 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP4P49662 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP4P49662 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP4P49662 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP4P49662 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP4P49662 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP4P49662 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP4P49662 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP4P49662 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP4P49662 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP4P49662 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP4P49662 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP4P49662 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP4P49662 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP4P49662 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP4P49662 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP4P49662 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP4P49662 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP4P49662 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP4P49662 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP4P49662 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP4P49662 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP4P49662 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP4P49662 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP4P49662 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP4P49662 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP4P49662 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP4P49662 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP4P49662 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP4P49662 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP4P49662 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP4P49662 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP4P49662 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP4P49662 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP4P49662 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP4P49662 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP4P49662 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP4P49662 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP4P49662 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP4P49662 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP4P49662 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP4P49662 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP4P49662 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP4P49662 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP4P49662 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP4P49662 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP4P49662 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP4P49662 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP4P49662 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP4P49662 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP4P49662 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP4P49662 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP4P49662 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP4P49662 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP4P49662 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP4P49662 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP4P49662 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP4P49662 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP4P49662 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP4P49662 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP4P49662 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP4P49662 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP4P49662 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP4P49662 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP4P49662 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP4P49662 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP4P49662 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms