Protein–RNA interactions for Protein: P21926

CD9, CD9 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD9P21926 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD9P21926 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CD9P21926 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD9P21926 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD9P21926 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD9P21926 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD9P21926 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD9P21926 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD9P21926 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD9P21926 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD9P21926 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD9P21926 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD9P21926 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD9P21926 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD9P21926 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD9P21926 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD9P21926 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CD9P21926 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD9P21926 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD9P21926 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD9P21926 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD9P21926 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD9P21926 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD9P21926 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD9P21926 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD9P21926 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD9P21926 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD9P21926 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD9P21926 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD9P21926 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD9P21926 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD9P21926 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD9P21926 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD9P21926 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD9P21926 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD9P21926 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD9P21926 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD9P21926 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD9P21926 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD9P21926 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD9P21926 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD9P21926 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CD9P21926 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD9P21926 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD9P21926 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD9P21926 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD9P21926 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD9P21926 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD9P21926 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD9P21926 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD9P21926 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD9P21926 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD9P21926 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD9P21926 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CD9P21926 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD9P21926 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD9P21926 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD9P21926 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD9P21926 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD9P21926 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CD9P21926 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD9P21926 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD9P21926 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD9P21926 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD9P21926 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD9P21926 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD9P21926 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD9P21926 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD9P21926 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD9P21926 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD9P21926 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD9P21926 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD9P21926 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD9P21926 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD9P21926 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD9P21926 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD9P21926 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD9P21926 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD9P21926 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD9P21926 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD9P21926 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD9P21926 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD9P21926 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD9P21926 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD9P21926 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD9P21926 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD9P21926 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD9P21926 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD9P21926 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD9P21926 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD9P21926 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD9P21926 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD9P21926 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD9P21926 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD9P21926 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD9P21926 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD9P21926 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD9P21926 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD9P21926 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD9P21926 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms