Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMD3O43242 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMD3O43242 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms