Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 REPIN1-207ENST00000473391 1064 ntTSL 219.01■□□□□ 0.631e-6■■■■■ 27.3
PRPF4O43172 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 27.3
PRPF4O43172 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 27.3
PRPF4O43172 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 27.3
PRPF4O43172 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 27.3
PRPF4O43172 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 27.3
PRPF4O43172 REPIN1-218ENST00000519397 583 ntTSL 414.72□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 27.3
PRPF4O43172 REPIN1-212ENST00000487455 464 ntTSL 48.82□□□□□ -11e-6■■■■■ 27.3
PRPF4O43172 SH3TC1-210ENST00000506360 5829 ntTSL 217.17■□□□□ 0.343e-6■■■■■ 27.2
PRPF4O43172 SH3TC1-206ENST00000502669 3484 ntTSL 1 (best)15.62■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 27.2
PRPF4O43172 SH3TC1-225ENST00000515682 4293 ntTSL 214.15□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 27.2
PRPF4O43172 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.213e-6■■■■■ 27.2
PRPF4O43172 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.879e-7■■■■■ 27.2
PRPF4O43172 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.729e-7■■■■■ 27.2
PRPF4O43172 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.689e-7■■■■■ 27.2
PRPF4O43172 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.659e-7■■■■■ 27.2
PRPF4O43172 ECI1-204ENST00000563029 776 ntTSL 224.03■■□□□ 1.449e-7■■■■■ 27.2
PRPF4O43172 ECI1-206ENST00000566379 961 ntTSL 221■□□□□ 0.959e-7■■■■■ 27.2
PRPF4O43172 ECI1-205ENST00000563447 965 ntTSL 215.31■□□□□ 0.049e-7■■■■■ 27.2
PRPF4O43172 RANBP1-211ENST00000448394 688 ntTSL 213.82□□□□□ -0.24e-7■■■■■ 27.2
PRPF4O43172 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.057e-7■■■■■ 27.2
PRPF4O43172 RNF111-205ENST00000559160 900 ntTSL 321.76■■□□□ 1.079e-7■■■■■ 27.2
PRPF4O43172 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.299e-7■■■■■ 27.2
PRPF4O43172 RNF111-202ENST00000557998 4803 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.649e-7■■■■■ 27.2
PRPF4O43172 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.749e-7■■■■■ 27.2
PRPF4O43172 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.541e-7■■■■■ 27.2
PRPF4O43172 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.541e-8■■■■■ 27.2
PRPF4O43172 ZC3H14-218ENST00000556158 849 ntTSL 322.59■■□□□ 1.211e-8■■■■■ 27.2
PRPF4O43172 ZC3H14-209ENST00000554602 652 ntTSL 522.56■■□□□ 1.21e-8■■■■■ 27.2
PRPF4O43172 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.151e-8■■■■■ 27.2
PRPF4O43172 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.111e-8■■■■■ 27.2
PRPF4O43172 ZC3H14-207ENST00000553495 577 ntTSL 320.85■□□□□ 0.931e-8■■■■■ 27.2
PRPF4O43172 ZC3H14-213ENST00000555799 813 ntTSL 318.77■□□□□ 0.61e-8■■■■■ 27.2
PRPF4O43172 ZC3H14-211ENST00000555755 2529 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.751e-8■■■■■ 27.2
PRPF4O43172 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.391e-8■■■■■ 27.2
PRPF4O43172 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.531e-8■■■■■ 27.2
PRPF4O43172 PHF1-210ENST00000488767 849 ntTSL 312.34□□□□□ -0.432e-7■■■■■ 27.2
PRPF4O43172 ATXN7L3-205ENST00000587097 1341 ntTSL 528.77■■■□□ 2.22e-7■■■■■ 27.1
PRPF4O43172 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.443e-7■■■■■ 27.1
PRPF4O43172 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.093e-7■■■■■ 27.1
PRPF4O43172 RANBP1-207ENST00000423859 832 ntTSL 317.41■□□□□ 0.384e-7■■■■■ 27.1
PRPF4O43172 RANBP1-205ENST00000418705 932 ntTSL 315.77■□□□□ 0.124e-7■■■■■ 27.1
PRPF4O43172 WDR6-211ENST00000471162 3565 ntTSL 1 (best)13.07□□□□□ -0.324e-7■■■■■ 27.1
PRPF4O43172 WDR6-204ENST00000420783 3656 ntTSL 1 (best)12.7□□□□□ -0.384e-7■■■■■ 27.1
PRPF4O43172 CERS4-202ENST00000557925 2401 ntTSL 516.26■□□□□ 0.194e-7■■■■■ 27.1
PRPF4O43172 POLR2E-207ENST00000590060 1052 ntTSL 519.35■□□□□ 0.692e-7■■■■■ 27.1
PRPF4O43172 TMEM129-205ENST00000480360 761 ntTSL 316.37■□□□□ 0.218e-7■■■■■ 27.1
PRPF4O43172 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.063e-11■■■■■ 27
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PRPF4O43172 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.233e-11■■■■■ 27
PRPF4O43172 PPP1CC-211ENST00000620030 582 ntTSL 222.38■■□□□ 1.173e-11■■■■■ 27
PRPF4O43172 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.043e-11■■■■■ 27
PRPF4O43172 PPP1CC-209ENST00000551690 603 ntTSL 320.24■□□□□ 0.833e-11■■■■■ 27
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PRPF4O43172 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.575e-8■■■■■ 27
PRPF4O43172 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.335e-8■■■■■ 27
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PRPF4O43172 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.225e-8■■■■■ 27
PRPF4O43172 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.015e-8■■■■■ 27
PRPF4O43172 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.915e-8■■■■■ 27
PRPF4O43172 SSX2IP-207ENST00000481102 2457 ntTSL 520.62■□□□□ 0.895e-8■■■■■ 27
PRPF4O43172 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.835e-8■■■■■ 27
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PRPF4O43172 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.555e-8■■■■■ 27
PRPF4O43172 KRT19-202ENST00000455635 641 ntTSL 318.09■□□□□ 0.495e-8■■■■■ 27
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PRPF4O43172 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.455e-8■■■■■ 27
PRPF4O43172 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.415e-8■■■■■ 27
PRPF4O43172 POFUT2-209ENST00000476653 598 ntTSL 217.55■□□□□ 0.45e-8■■■■■ 27
PRPF4O43172 SLC46A1-205ENST00000584426 564 ntTSL 416.36■□□□□ 0.215e-8■■■■■ 27
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PRPF4O43172 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.175e-8■■■■■ 27
PRPF4O43172 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.135e-8■■■■■ 27
PRPF4O43172 ARPC4-207ENST00000485273 577 ntTSL 215.81■□□□□ 0.125e-8■■■■■ 27
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PRPF4O43172 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.165e-8■■■■■ 27
PRPF4O43172 POFUT2-212ENST00000493811 577 ntTSL 313.93□□□□□ -0.185e-8■■■■■ 27
PRPF4O43172 POFUT2-211ENST00000493524 890 ntTSL 513.82□□□□□ -0.25e-8■■■■■ 27
PRPF4O43172 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.215e-8■■■■■ 27
PRPF4O43172 POFUT2-203ENST00000349485 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.275e-8■■■■■ 27
PRPF4O43172 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.275e-8■■■■■ 27
PRPF4O43172 DTX2P1-201ENST00000425797 1633 ntBASIC13.34□□□□□ -0.275e-8■■■■■ 27
PRPF4O43172 POFUT2-213ENST00000612472 2959 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.285e-8■■■■■ 27
PRPF4O43172 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.315e-8■■■■■ 27
PRPF4O43172 POFUT2-202ENST00000334538 3077 ntTSL 1 (best)12.99□□□□□ -0.335e-8■■■■■ 27
PRPF4O43172 SSX2IP-201ENST00000342203 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.345e-8■■■■■ 27
PRPF4O43172 SPATA2-201ENST00000289431 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.365e-8■■■■■ 27
PRPF4O43172 KHSRP-210ENST00000599395 837 ntTSL 512.72□□□□□ -0.375e-8■■■■■ 27
PRPF4O43172 ABCD1-201ENST00000218104 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.45e-8■■■■■ 27
PRPF4O43172 POFUT2-207ENST00000468360 757 ntTSL 512.43□□□□□ -0.425e-8■■■■■ 27
PRPF4O43172 NAMPT-209ENST00000484527 833 ntTSL 312.31□□□□□ -0.445e-8■■■■■ 27
PRPF4O43172 BEND3-201ENST00000369042 6200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.55e-8■■■■■ 27
PRPF4O43172 PLEKHA7-209ENST00000529213 561 ntTSL 411.11□□□□□ -0.635e-8■■■■■ 27
PRPF4O43172 ARPC4-206ENST00000479956 506 ntTSL 410.71□□□□□ -0.695e-8■■■■■ 27
PRPF4O43172 AC099811.2-202ENST00000592248 694 ntTSL 310.49□□□□□ -0.735e-8■■■■■ 27
PRPF4O43172 SLC46A1-202ENST00000581516 844 ntTSL 59.91□□□□□ -0.825e-8■■■■■ 27
PRPF4O43172 ARPC4-205ENST00000467289 729 ntTSL 28.84□□□□□ -0.995e-8■■■■■ 27
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