Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN2DO15399 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN2DO15399 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN2DO15399 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN2DO15399 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN2DO15399 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2DO15399 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2DO15399 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2DO15399 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2DO15399 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2DO15399 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2DO15399 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2DO15399 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2DO15399 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2DO15399 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2DO15399 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2DO15399 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2DO15399 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2DO15399 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2DO15399 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2DO15399 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2DO15399 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN2DO15399 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN2DO15399 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN2DO15399 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN2DO15399 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN2DO15399 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN2DO15399 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN2DO15399 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN2DO15399 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN2DO15399 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN2DO15399 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN2DO15399 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN2DO15399 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN2DO15399 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN2DO15399 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN2DO15399 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN2DO15399 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN2DO15399 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN2DO15399 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIN2DO15399 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIN2DO15399 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIN2DO15399 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIN2DO15399 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIN2DO15399 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIN2DO15399 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN2DO15399 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN2DO15399 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN2DO15399 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN2DO15399 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN2DO15399 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN2DO15399 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN2DO15399 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN2DO15399 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN2DO15399 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN2DO15399 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN2DO15399 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN2DO15399 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN2DO15399 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms