Protein–RNA interactions for Protein: O15111

CHUK, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHUKO15111 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHUKO15111 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHUKO15111 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHUKO15111 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHUKO15111 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHUKO15111 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHUKO15111 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHUKO15111 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHUKO15111 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHUKO15111 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHUKO15111 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHUKO15111 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHUKO15111 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHUKO15111 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHUKO15111 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHUKO15111 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHUKO15111 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHUKO15111 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHUKO15111 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHUKO15111 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHUKO15111 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHUKO15111 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHUKO15111 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHUKO15111 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHUKO15111 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHUKO15111 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHUKO15111 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHUKO15111 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHUKO15111 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHUKO15111 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHUKO15111 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHUKO15111 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHUKO15111 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHUKO15111 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHUKO15111 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHUKO15111 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHUKO15111 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHUKO15111 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHUKO15111 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHUKO15111 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHUKO15111 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHUKO15111 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHUKO15111 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHUKO15111 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHUKO15111 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHUKO15111 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHUKO15111 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHUKO15111 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHUKO15111 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHUKO15111 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHUKO15111 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHUKO15111 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHUKO15111 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHUKO15111 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHUKO15111 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHUKO15111 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHUKO15111 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHUKO15111 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHUKO15111 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHUKO15111 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHUKO15111 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHUKO15111 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHUKO15111 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHUKO15111 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHUKO15111 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHUKO15111 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHUKO15111 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHUKO15111 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHUKO15111 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHUKO15111 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHUKO15111 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHUKO15111 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHUKO15111 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHUKO15111 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHUKO15111 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHUKO15111 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHUKO15111 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHUKO15111 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHUKO15111 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHUKO15111 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHUKO15111 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHUKO15111 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHUKO15111 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHUKO15111 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHUKO15111 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHUKO15111 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHUKO15111 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHUKO15111 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHUKO15111 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHUKO15111 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHUKO15111 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHUKO15111 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHUKO15111 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHUKO15111 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHUKO15111 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHUKO15111 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHUKO15111 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHUKO15111 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHUKO15111 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHUKO15111 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms