Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
J3KRW8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
J3KRW8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
J3KRW8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
J3KRW8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
J3KRW8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
J3KRW8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
J3KRW8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
J3KRW8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
J3KRW8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
J3KRW8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
J3KRW8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
J3KRW8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
J3KRW8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
J3KRW8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
J3KRW8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
J3KRW8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
J3KRW8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
J3KRW8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
J3KRW8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
J3KRW8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
J3KRW8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
J3KRW8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
J3KRW8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
J3KRW8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
J3KRW8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
J3KRW8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
J3KRW8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
J3KRW8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
J3KRW8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
J3KRW8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
J3KRW8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
J3KRW8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
J3KRW8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
J3KRW8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
J3KRW8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
J3KRW8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
J3KRW8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
J3KRW8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
J3KRW8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
J3KRW8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
J3KRW8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
J3KRW8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
J3KRW8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
J3KRW8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
J3KRW8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
J3KRW8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
J3KRW8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
J3KRW8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
J3KRW8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
J3KRW8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
J3KRW8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
J3KRW8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
J3KRW8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
J3KRW8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
J3KRW8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
J3KRW8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
J3KRW8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
J3KRW8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
J3KRW8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
J3KRW8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
J3KRW8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
J3KRW8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
J3KRW8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
J3KRW8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
J3KRW8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
J3KRW8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
J3KRW8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
J3KRW8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
J3KRW8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
J3KRW8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
J3KRW8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
J3KRW8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
J3KRW8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
J3KRW8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
J3KRW8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
J3KRW8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
J3KRW8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
J3KRW8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
J3KRW8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
J3KRW8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
J3KRW8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
J3KRW8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
J3KRW8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
J3KRW8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
J3KRW8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
J3KRW8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
J3KRW8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
J3KRW8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
J3KRW8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
J3KRW8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
J3KRW8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
J3KRW8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
J3KRW8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
J3KRW8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
J3KRW8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
J3KRW8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
J3KRW8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
J3KRW8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
J3KRW8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
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