Protein–RNA interactions for Protein: A6NHY6

C9orf118, Putative uncharacterized protein C9orf118, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf118A6NHY6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C9orf118A6NHY6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf118A6NHY6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf118A6NHY6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf118A6NHY6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf118A6NHY6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf118A6NHY6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf118A6NHY6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf118A6NHY6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf118A6NHY6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf118A6NHY6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf118A6NHY6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf118A6NHY6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C9orf118A6NHY6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf118A6NHY6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf118A6NHY6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf118A6NHY6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf118A6NHY6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf118A6NHY6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf118A6NHY6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf118A6NHY6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf118A6NHY6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf118A6NHY6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf118A6NHY6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf118A6NHY6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf118A6NHY6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf118A6NHY6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf118A6NHY6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf118A6NHY6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf118A6NHY6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms