Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms