Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms