Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
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DDB1Q16531 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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DDB1Q16531 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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DDB1Q16531 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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DDB1Q16531 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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DDB1Q16531 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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DDB1Q16531 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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DDB1Q16531 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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DDB1Q16531 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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DDB1Q16531 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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DDB1Q16531 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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DDB1Q16531 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DDB1Q16531 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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