Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XRCC4Q13426 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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