Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGP37231 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGP37231 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGP37231 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGP37231 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGP37231 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGP37231 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGP37231 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGP37231 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARGP37231 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGP37231 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGP37231 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGP37231 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGP37231 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGP37231 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGP37231 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGP37231 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGP37231 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGP37231 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGP37231 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGP37231 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGP37231 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGP37231 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGP37231 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGP37231 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGP37231 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGP37231 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGP37231 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGP37231 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGP37231 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGP37231 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGP37231 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGP37231 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGP37231 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGP37231 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGP37231 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGP37231 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARGP37231 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARGP37231 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PPARGP37231 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms