Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SS18Q15532 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SS18Q15532 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SS18Q15532 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SS18Q15532 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SS18Q15532 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SS18Q15532 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SS18Q15532 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SS18Q15532 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SS18Q15532 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SS18Q15532 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SS18Q15532 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SS18Q15532 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
SS18Q15532 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SS18Q15532 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SS18Q15532 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SS18Q15532 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SS18Q15532 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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