Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAPVD1Q14C86 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GAPVD1Q14C86 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
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