Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
CHRNA7P36544 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms