Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CELF4Q9BZC1 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms