Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ3

TXNDC2, Thioredoxin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC2Q86VQ3 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TXNDC2Q86VQ3 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TXNDC2Q86VQ3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TXNDC2Q86VQ3 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TXNDC2Q86VQ3 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TXNDC2Q86VQ3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TXNDC2Q86VQ3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TXNDC2Q86VQ3 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TXNDC2Q86VQ3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TXNDC2Q86VQ3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TXNDC2Q86VQ3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TXNDC2Q86VQ3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TXNDC2Q86VQ3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
TXNDC2Q86VQ3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TXNDC2Q86VQ3 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TXNDC2Q86VQ3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TXNDC2Q86VQ3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TXNDC2Q86VQ3 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TXNDC2Q86VQ3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TXNDC2Q86VQ3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TXNDC2Q86VQ3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TXNDC2Q86VQ3 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TXNDC2Q86VQ3 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TXNDC2Q86VQ3 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms