Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
IMPG1Q17R60 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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